创新管理研究中心原名为“技术经济与管理研究中心”，该中心成立于2002年4月，系校属重点研究基地，依托技术经济及管理学科，坚持科研与教学相长、与社会实践紧密结合，在科学研究、人才培养、学术交流、社会服务以及政策咨询等方面均取得了显著成绩，为推动技术经济及管理学科的发展和提升吉林大学技术经济及管理学科的地位发挥了非常积极的作用。2009年5月开始，中心领导组织人员进行充分的调研和多次研讨提出将该中心更名为“创新管理研究中心”，既有利于突破技术经济及管理学科的框架，又能在更大的学术视野中寻求发展，还能为申报教育部人文社会科学重点研究基地做准备。因此，2010年1月该中心正式更名为“创新管理研究中心”。